Kaikki Suomessa asuvat koirat tulee tunnistusmerkitä ja rekisteröidä Ruokaviraston ylläpitämään viranomaisrekisteriin. Rekisterin tarkoituksena on pyrkiä ehkäisemään pentutehtailua ja koirien laitonta maahantuontia, sekä nopeuttaa löytökoirien palautumista.
Koirien tunnistamista ja rekisteröintiä valvotaan eläintunnistuslain (1069/2021) nojalla. Toimivaltaisia viranomaisia ovat kunnaneläinlääkäri, aluehallintovirasto (läänineläinlääkäri) ja ELY-keskus (ELY-keskusten eläinvalvojat). Tulli valvoo tunnistamista ja rekisteröintiä rajalla siirrettäessä eläimiä jäsenvaltioiden välillä. Tunnistamisen ylimääräinen valvonta on maksullista, kun todetaan, että lainsäädäntöä ei ole noudatettu. Maksu määräytyy kunkin viranomaisen maksutaksan mukaisesti. Kunnaneläinlääkärin valvontamaksu on 150 € (MMM asetus kunnaneläinlääkärien maksullisista suoritteista 1286/2023). Lisäksi kokonaan tunnistusmerkitsemättömästä koirasta voidaan määrätä seuraamusmaksu (alkaen 300 €).